Результаты секвенирования жидких биоптатов. Использование библиотечного набора для подготовки свободной ДНК (cfDNA), позволяет получать высококачественные данные для раннего выявления рака.
Современные врачи и ученые все больше осознают важность молекулярного тестирования для раннего выявления рака. Анализ свободной ДНК (cfDNA) устраняет необходимость в инвазивной биопсии тканей для выявления, диагностики и мониторинга прогрессирования заболевания.
Чтобы идентифицировать мутации, исследователи должны сначала провести экстракцию cfDNA из образцов жидкой биопсии крови, а затем подготовить библиотеку для секвенирования следующего поколения. В случае анализа на рак на этапе секвенирования в конечном итоге обнаруживаются циркулирующие фрагменты ДНК опухолевого происхождения из исходной опухоли в общей коллекции cfDNA. Однако количество свободной ДНК в жидких биоптатах часто невелико, отчасти из-за их деградации ДНК-киназами кровотока.
Это затрудняет подготовку библиотеки, которая надежно фиксирует и преобразует всю фрагментированную ДНК в жидкий образец для биопсии, а также последующее выявление редких вариантов рака. Чтобы повысить надежность жидких биопсий, ученые ищут способы оптимизировать каждый этап процесса секвенирования свободной ДНК, особенно этап подготовки библиотеки.
Компания Twist Bioscience предлагает набор для подготовки библиотеки cfDNA, который подходит для любого процесса секвенирования жидкой биопсии, обеспечивая более высокую конверсию и, следовательно, более высокий выход библиотеки по сравнению с другими коммерческими наборами. Кроме того, набор Twist Bioscience позволяет получать высокоточные и чувствительные данные для секвенирования, что важно для выявления низких частот вариантных аллелей. В целом, использование надежного набора для подготовки библиотеки cfDNA помогает ученым обрести уверенность в своих результатах, особенно при раннем выявлении рака.
https://www.the-scientist.com/enhanced-sequencing-results-from-liquid-biopsies-72018
